На този ден (февруари. Самолетът се разби, уби и Зее, и неговия съотборник Чарли Басет.
Аварията изпрати ударни вълни през малкия корпус на астронавтите и също наложи някои прибързани преназначавания. Резервният екипаж на Gemini 9 на Том Стафорд и Юджийн Чернан веднага става главен екипаж и стартира в космоса на 17 май 1966 г. при мисия, включваща предизвикателна космическа пътека за Чернан.
Но според Деке Слейтън, който по това време е отговарял за подбора на екипажа, смъртта на Зее и Басет дори се е отразила на лунните мисии на Аполон.
„Имах много планове за Чарли Басет - след GT-9 [Близнаци 9] той щеше да премине към пилота на командния модул за екипажа на Аполон на Франк Борман. Елиът щеше да бъде резервен командир за GT-12 “, пише Слайтон в мемоара си Дийк!, което той създаде с помощта назона на здрачаписател (и автор на множество книги) Майкъл Касут.
Според Слайтон загубата на този екипаж се отрази на задачи до първия екипаж, който кацна на Луната: Нийл Армстронг и Бъз Олдрин на Аполон 11. (Майкъл Колинс също беше в мисията, но остана в орбита в командването модул).
"Всички резервни копия бяха променени, а Джим Ловел и Бъз Олдрин се завъртяха, като бяха насочени към GT-12", пише Слейтън. „Без летене на GT-12 беше много малко вероятно Buzz да е в състояние да бъде пилот на лунния модул при първия опит за кацане.“
Възможно е тази катастрофа дори да е засегнала Аполон 13, който се случи четири години по-късно.
Джим Ловел летеше на Аполон 8 като пилот на командния модул. Докато Слайтон не го е заявил, опитът на Ловел в тази мисия вероятно е довел до назначаването му за командир на Аполон 14. Съдбата след това го премества напред в полет към злополучния Аполон 13, който е осакатен от експлозия на кислороден резервоар, след като първоначалният командир на този полет, Ал Шепард, изискваше малко повече време за обучение.
Що се отнася до Зее и Басет, останките им са погребани на Националното гробище в Арлингтън, където също са дом на много други паднали екипажи. Няколко членове на екипажа от Аполон 1, бедствието в Челенджър и бедствието в Колумбия са положени да почиват там.
